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lncRNA一站式服务

lncRNA一站式服务

lncRNA


长链非编RNA(long noncoding RNAlncRNA)是一类不编码蛋白RNA (rRNA),长度200bp以上,RNA的形式在多种层(表观遗传水平、转录水平和转录后水)上调控基因的表达水平。近期的研究表lncRNA具有保守的二级结构,可以与蛋白DNARNA相互作用,参与多种生物学过程的调控,尤其在肿瘤当中发挥了重要的调控角色,如染色质修饰、转录激活和抑制、转录后调解以及作miRNA的诱导分子干扰基因的表达等。目前lncRNA已经成为继信使RNA(mRNA)RNA(microRNApiRNA siRNA)之后功能基因组学最火热的研究领域,但是绝大部lncRNA的功能目前仍不清楚。

特征:

· 大部lncRNA的生成 mRNA 类似,也是 RNA 聚合的催化作用下进行转录,然后进行剪切修饰,生 poly(A)尾,也有一部分 RNA 聚合产生,没 poly(A)尾。

· lncRNA的序列本保守性较低,但具有保守的二级结构,剪切形式以及亚细胞定位。

· 分布广泛,表达具有组织特异性和时空特异性

· 在肿瘤与其他疾病中有特征性的表达方式。


lncRNA这几年可谓研究的热火朝天,各种基金申请,各lncRNA最新研究铺天盖地袭来,这里我们就来说lncRNA究竟都做了哪些研究?

1、差异表达筛选
lncRNA芯片RNA-seq测序等方法对多对疾病模型和对照样本组织进lncRNA表达谱分析。
2、生物信息分析
通过生物信息学的方法筛选出具有表达差异lncRNA,构建共表达网络,预lncRNA的靶基因。
3、细胞分子水平研究
1)功能获得性研究:构lncRNA过表达载体
2)功能缺失性研究:可通siRNAshRNA、反义核酸等方法沉lncRNA,干lncRNA后检测其对疾病相关基因表达的影响和对细胞表型如增值、凋亡、侵袭、转移等的影响
3)可通RNA pull downRNA-RIPChIRP-seq等方法检测lncRNA结合DNARNA、蛋白质。
4、动物实验
1)构建移植瘤或原位瘤模型,转移模型
2)导siRNAlncRNA表达质粒
3)检测肿瘤生长曲线
4)通过免疫组化RT-PCRWestern Blot等方法检测相关指标变化。